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2025-08-181033 次瀏覽
論文 | 不用擴增也能測microRNA?耐思胎牛血清養出的細胞給出高分答案

文章名稱:Regulating cleavage activity and enabling microRNA detection with split sgRNA in Cas12b

中文名稱:基于Cas12b的分裂型sgRNA,實現其切割活性調控,并支持microRNA檢測

雜志名:Nature Communications

期刊影響因子:15.7

第一作者:Jiaqi Wang

通訊作者:Zhaoxing Liu

發表日期:2025.07.10

doi:10.1038/s41467-025-61748-4


研究內容

內容概述:本研究提出了一種將Cas12bsgRNA 拆分為兩個片段(即“分裂 sgRNA”)的策略。該策略利用通用骨架結構與可定制的 Spacer 區域相結合,實現了對 Cas12b 切割活性的精確調控。同時,此方法支持無需核酸擴增的 microRNA 直接檢測。研究結果表明,通過優化 sgRNA 結構可有效降低脫靶效應并抑制背景切割信號,從而構建了一個具有高靈敏度和高特異性的 microRNA 檢測平臺。


研究背景

基因編輯和核酸檢測領域,Cas12b是一種極具潛力的 CRISPR-Cas 系統。然而,傳統 sgRNA 設計易引發背景切割和脫靶效應,需更精細的活性調控策略。同時,作為重要生物標志物的 microRNA,其檢測面臨濃度低、結構復雜等挑戰。為此,本研究旨在開發一種新型 sgRNA 架構,在實現對 Cas12b 活性精準調控的同時,支持無需擴增的 microRNA 直接檢測。


實驗方法與過程

  • sgRNA 分裂設計:將 sgRNA 拆分為 scaffold 部分與 Spacer 部分分別表達或組裝。

  • 活性調控評估:通過體外Cas12b 切割實驗驗證不同組合,測定切割效率與背景活性。

  • microRNA 檢測方案建立:結合報告片段和熒光信號輸出,無需逆轉錄擴增即可檢測目標 microRNA。

  • 靈敏度與特異性測試:在多種microRNA 濃度梯度中測試檢測下限與選擇性。


Cas12b的sgRNA和分裂sgRNA的方案概述

 

實驗結果

  • 活性調控:成功拆分sgRNA 顯著降低 Cas12b 的非特異背景切割,僅在配對正確 Spacer 后激活強信號。

  • 高靈敏檢測:檢測下限達到picomolar 級別,背景噪音較低。

  • microRNA 特異性良好:能區分近似序列差異較小的 microRNA,通過 Spacer 定制即可切換檢測目標。



結論

split sgRNA 的設計具備普適性,只需更換 Spacer 即可擴展至不同 microRNA 或 DNA 靶標,無擴增的檢測方法可以簡化流程、降低成本與污染風險。平臺具備潛力推廣至臨床快速診斷設備或現場檢測(POCT)應用。未來可與納米載體、光學傳感設備等結合,提升整體檢測便利性與應用范圍。

使用改良的CRISPR-Cas12b 系統檢測 miR-17、2131 和 92a 的表達量

使用同樣的檢測方法檢測健康人(H.D.15)、結直腸癌患者術前(P.D.15 preO) 和 術后(P.D.15 postO) 血漿總 RNA 中的 miR-1721、31 和 92a 水平


Cas12b split sgRNA 方法 與傳統 RT-qPCR 方法對比









論文中用到的NEST產品


胎牛血清

實驗:細胞培養

涉及細胞類型:HCT116,SW480NCM460

在本實驗中,研究人員使用含FBS的培養基分別培養了結直腸癌細胞系 HCT116、SW480 及正常腸上皮細胞系 NCM460,并從中提取 microRNA。隨后,他們利用開發的 split sgRNA-Cas12b 方法檢測了 miR-17、miR-21、miR-31 和 miR-92a,并與傳統 RT-qPCR 結果進行對比。結果顯示,癌細胞中 microRNA 表達量顯著高于正常細胞,兩種方法結果高度一致。此外,還檢測了結直腸癌患者術前術后及健康人群血漿中的 microRNA 水平,驗證了其在腫瘤診斷和術后監測中的應用潛力。


NEST胎牛血清的優勢



NEST胎牛血清是從牛胎中抽取的血液凝固后剩余的液體部分,通過離心去除細胞、凝固纖維蛋白原和蛋白以得到血清,含有許多有助于細胞生長的成分,包括:如生長因子、附著因子、激素、轉運蛋白、脂質、糖類、維生素等。


胎牛血清制作流程圖


NEST? 胎牛血清(FBS)國際高標準 × 國產優價格,一瓶解決細胞“營養焦慮”
NEST所有批次的胎牛血清均經過嚴格的無菌、支原體和病毒檢測。每一批次的血清也會在以下細胞系上進行細胞生長、平板效率和克隆效率測試:HeLa、L929、SP2/O-AG14、MRC-5經過認證和特別認證的血清還需要進行一系列額外的測試,包括內毒素、化學成分、蛋白電泳和放射免疫擴散檢測等。
?來源可靠:采自健康胎牛心臟無菌穿刺血,低抗體、低補體,從源頭降低免疫干擾。
?成分豐富: 富含生長因子(EGF、FGF、IGF 等)、附著蛋白(Fibronectin、Vitronectin)及激素、微量元素,滿足貼壁、懸浮、干細胞、原代細胞等多場景需求。
?質量嚴控:0.1 μm 三級過濾 + 10 項放行檢測:無菌、支原體、病毒、總蛋白質量:40±5g/L、內毒素<5 EU/mL、血紅蛋白<30 mg/100 mL,批間差異≤10 %。
?性能驗證:HeLa、L929、SP2/0-AG14、MRC-5 多重細胞生長/克隆/鋪板實驗確認促增殖效率≥80 %,結果穩定可重復。
?合規追溯:ISO9001 / ISO13485 / GMP 體系生產,每瓶唯一批號,完整溯源鏈支持 SCI 論文及 IND 申報。

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